张雪峰不建议考科研院所，是因为和科研院所比，考高校有很多优势，如毕业证和学位证书所显示的名气，高校比科研院所有名，虽然科研院所在名校学习，但是毕业证和学位证是科研院所的。此外，考生不用签约，毕业就是自由身，当然这也是双刃剑。
研究所的导师事业经费多、性质具有一定局限性、文献资源总量小。
考研考高校和研究院的对比：
1、文献方面
研究所的文献资源总量小于高校，但人均占有量远远高于高校。研究所往往不会像高校那样，每年花大量资金购买电子资源（高校各类文献数据库十分全面），它们的资源范围更窄且更具针对性，而且会有些特色的数据库。
2、经费方面
高校的导师科研经费多，而研究所的导师事业经费多。在高校，导师拿下的项目主要是靠研究生干；而在研究所，研究生在项目中并不是主力，因为研究所往往有较为稳定的团队。
3、名气方面
研究所一般会专注于某一确定领域，就会在该领域享有盛誉；但由于其性质具有一定局限性，名气在外行看来可能不如高校，若毕业后进入其他行业，则不如高校顺利。
待遇，在所里读研很大概率比在高校里要有钱，虽然没有奖学金这一说，但是呢，每个月工资啊，2000块钱一个月可能都算少的啦，而且吃住全免，住宿条件比学校要好，学校是四人间，一般在所里的话呢，有可能是两人间或者是单人间。因为有雄厚的经济实力做后盾，如果说你是一个特别喜欢做科研的同学，那当你的小伙伴们在高校里可能还要通过校外的兼职来挣一点生活费的时候，你可能已经开始实现小资生活了，更能静下心来安静的呆在实验室里做科研。
那第二个呢，就是产学研一体了，一旦你进到所里啊，大家就不要把自己的身份还定位成一个学生了，你更像是一个上班族了，你的导师相当于你的直属领导，你和你的同事们一起，大家并肩作战，也是承受着比较大的一个科研压力，你可以一边工作一边学习啊，所以整个人的学术能力呢，也是能够得到很高的提升啊。如果你的运气特别好，跟到了一个特别的国家级项目的话，未来可以进一步留在所里工作，甚至于进一步地来供读你的博士学历。
